空间产物

通过接纳尖端的空间手艺,能够在保持细胞原shi空间位置的同时,准确剖析和可视化基因表达和卵白标志等,深入研究组织微情形中的细胞互作。

10x Genomics空间转录组(含Visium HD)

将基因空间表达可视化,在识别差异细胞群的同时保留空间配景,提供了关于组织微情形中细胞功效、表型和位置关系的关jian信息。

Stereo-seq空间转录组

gai手艺通过时空芯片捕捉组织中的 mRNA,并通过空间条形码(Coordinate ID,CID)还原回空间位置实现组织原位测序,为深入地相识细胞的基因表达及形态与局部情形之间的关系建设强盛的研究基础。

Akoya空间卵白组

可提供同时检测几种(PhenoImager Fusion)到100多种(PhenoCycler-Fusion)生物卵白标志物的解决方案,准确定位细胞空间漫衍、判断细胞行为、识别差异的细胞群集模式,实现组织原位超多靶点卵白标志剖析。

应用偏向
  • 肿瘤及免疫研究:有助于识别肿瘤微情形中的细胞相互作用,以及免疫细胞在肿瘤希望和治疗反映中的角色;
  • 病理学研究:通过在组织切片上举行高分辨率的分子表达剖析,有助于展现疾病的分子机制和组织中的病理转变;
  • 发育生物学:通太过析发育历程中细胞在空间上的漫衍和基因表达转变,展现细胞分化和组织形态形成的动态历程;
  • 空间图谱:构建器官和组织的空间图谱,展示细胞在特定心理和病理状态下的空间漫衍和相互作用,这对于明确重大生物系统的结构和功效至关主要;
  • 生物标志物挖掘:通太过析细胞在特定组织情形中的表达模式,可以识别与疾病历程、治疗响应或预后相关的关jian分子标志物;
产物优势
高分辨率实现亚细胞级分子定位

Stereo-seq、Visium HD和Akoya空间卵白组均能到达亚细胞级的分辨率,实现对单个细胞及分子信息举行空间定位和检测

展现差异区域中细胞的组成及功效状态

可视化肿瘤细胞、免疫细胞等多种细胞的亚型,详细识别差异区域中的免疫细胞的漫衍及组成,可实现同时展示样本间以及差异区域的差异和功效状态

更深层ci明确组织微情形,发现有数细胞和生物标志物

凭证对肿瘤切片样本中单细胞分辨率下目的分子标志物的表达定位,准确判断目的细胞类型的漫衍,绘制肿瘤免疫微情形景观图谱,可发现以wang容易忽略的有数细胞、细小结构

案例剖析

头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)肿瘤微情形空间激活途径

单细胞团结空间转录组展现头颈鳞状细胞癌肿瘤微情形中zeng殖型耗竭CD8+T细胞作用

 

gai研究使用单细胞水平的多组学手艺构建了人头颈鳞状细胞癌的多维度肿瘤微情形图谱,从中判断出了一群具有zeng殖潜能并能一连施展抗瘤效应的新zeng殖型耗竭CD8+T细胞,并深入剖析了其在肿瘤微情形中的作用机制。本研究系统性地剖析了头颈鳞状细胞癌微情形中zeng殖型耗蝎CDB+T细胞的多维度特征,证实了其品貌与HPV阳性头颈鲜状细胞癌患者预后间的关联性,以耗竭CD8+T细胞异质性为切入点,为HPV熏染状态怎样影响CDK4抑制剂对头颈鲜状细胞癌的疗效提供了新的诠释,有助于推动头颈鲜状细胞癌精准治疗的进一步生长。

参考文献:Cheng D, Qiu K,Rao Y. et al. Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma [J]. Elife. 2023 Feb 22:12:e82705.


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