变异检测（二代测序/三代测序）

对已知基因组序列的物种举行差异个体的基因组测序，通过序列比对可以检测到大量变异信息，包罗单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失（InDel）、结构变异（SV）和拷贝数变异（CNV）等，在全基因组水平上发现差异个体或组织细胞之间的差异信息，从而获得生物群体的遗传特征。

群体进化（二代测序/三代测序）

通过获得某物种自然群体各亚群的SNP、InDel、CNV和SV等变异信息，剖析群体的遗传多样性、遗传结构、群体进化动态等生物学问题，从分子层面深入研究gai物种的进化历程。

GWAS全基因组关联剖析（二代测序/三代测序）

全基因组关联剖析（Genome Wide Association Study，GWAS）通过对多个个体在全基因组规模内的遗传变异（标志）多态性举行检测，获得基因型，进而将基因型与可视察的性状（表型），举行群体水平的统计学剖析，凭证统计量或显著性P值筛选出最有可能影响gai性状的遗传变异（标志），挖掘与性状变异相关基因。

BSA性状定位（二代测序）

BSA（Bulked segregation analysis）即混淆分组剖析，也称疏散群体分组剖析，是一种通过在群体中挑选极端或代表性性状（单一性状）的个体组成混池举行剖析的要领。通过研究混池之间等位基因/分子标志频率的差异，将与性状相关的位点在基因组上举行定位。

指纹图谱（二代测序）

通过SNP标志视察样品中DNA的奇异的模式来识别个体的要领，可提供富厚的个体特异性遗传标志，对于品种判断与知识产权的掩护、品种亲缘关系和分类研究具有主要意义。

焦点种质（二代测序）

接纳一定要领，从生涯的种质资源中抽取一个焦点子集，以较少的遗传资源样本量最大限度地生涯代表整个资源群体的遗传多样性，同时代表了整个群体的地理漫衍。