人基因组重测序
人基因组重测序可周全扫描人类基因组上的变异信息,一ci性挖掘大量的生物标志物,gai手艺准确性高、可重复性好、定位准确,已被普遍应用于疾病、癌症的基因组研究。
人全基因组重测序(二代测序/三代测序)
人全基因组重测序(Whole-Genome Sequencing,WGS)对人类差异个体或群体举行基因组测序,在全基因组规模内挖掘DNA水平遗传变异,周全挖掘基因组的SNV/InDel/CNV/SV等种种变异。其中,三代测序凭jie超长读长、无偏向性等优势对大片断的结构变异检测有更好的检出率,同时对一些重大的SV也能够很好的检测出来。人全基因组重测序是现在获得人基因信息较为周全的测序手段,也是研究与辅助治疗人类疾病主要的方式。
人全外显子组测序
全外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES)是使用探针捕捉和富集外显子区域DNA序列,再通过高通量测序和剖析获得与疾病相关的致病突变信息。人类基因组外显子只占整个基因组的1%,但其包罗了约85%的致病突变,WES测序深度更高,有利于发现常见变异、低频变异和有数变异,且测序用度更低、周期更短。
人全外显子关联剖析
通过全外显子组测序(WES)测序手艺检测患者之间的基因差异,找出导致致病性差异的基因变异,探讨基因型差异与表型差异之间的相关性,以期展望疾病表型发生,使治疗越发个体化。
低深度WGS CNV-seq
CNV(Copy Number Variation)是一种常见的基因组变异,研究人基因组中的 CNV有助于发现新的遗传致病因子和相识其多态性水平与进化历程。使用低深度 WGS 检测人基因组 CNV 具有分辨率高,检测周全且成本低廉等优势,适用于大规容貌本的 CNV 剖析。
应用先容
- 个体差异和种群遗传学:研究个体之间的DNA差异,有助于剖析人类遗传变异信息,以及变异怎样影响个体的康健和易感性;
- 疾病发生气制:较量正:图膊∽刺碌腄NA差异,挖掘与疾病发生和希望相关的变异,zeng进对疾病发生和生长历程的明确;
- 肿瘤进化机制:使用更深的基因笼罩,挖掘更周全的肿瘤变异信息,剖析肿瘤致病机理、转移/复发机制、易感基因、耐药机制、异质化及肿瘤进化;
- 药物基因组:寻找药物疗效/清静性相关遗传突变、研究遗传变异在个体药物反映差异性中施展的作用,指导精准用药及个体化治疗;
- 基因诊断:资助提高临床上难以诊断疾病的诊断率;
文章案例

致病性SV及样本qing况
HiFi测序展现综合征性智力障碍的致病性结构变异
日本横滨市立大学医学院和大阪市妇女儿童医院的科学家对一对患有综合征智力障碍的同卵双胞胎女孩举行PacBio HiFi测序,以探索之前未被全外显子测序检测到的致病变异。通过Trio家系样本和数据库过滤,获得一个12kb的倒位变异,gai倒位直接破损了CPNE9和BRPF1两个基因并可能导致基因功效损失。此外,基于Trio样本的单倍型定相剖析还发现gai倒位遗传自母亲。gai研究清晰地批注晰亚显微拷贝中性倒位的主要性, 以及使用长读长测序手艺检测遗传病中这种变异的价值。
参考文献:Mizuguchi Takeshi, Okamoto Nobuhiko, Yanagihara Keiko et al. Pathogenic 12-kb copy-neutral inversion in syndromic intellectual disability identified by high-fidelity long-read sequencing[J]. Genomics, 2021, 113: 1044-1053.